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正常男子的阴茎，除了在性刺激和某种外界刺激会勃起外，通常处于松弛状态。但是有时内脏器官的反射作用也会导致阴茎勃起。
最明显的是早晨清醒前时常会出现阴茎勃起多，致使膀胱内压力增加而产生刺激作用，可以导致阴茎发生一种潜意识的反射性勃起，也就是常常说的让尿给“憋”硬了，这是一种正常的生理现象，医学上称之为清晨勃起。但这种勃起现象的强度或大或小，从来达不到性交所特有的水平。
据美国一位学者的研究资料报道，男子在成年后，20～30岁时，清晨勃起次数增多，中年以后逐渐减少。一位德国医生也研究了这个生理现象，他发现男子在疾病期间，清晨阴茎勃起的现象会消失，当身体康复后，清晨阴茎勃起的现象又重新出现。于是他提出，清晨阴茎勃起现象可以作为观察男子精力和健康状况的参考指标之一。
但是，关于清晨阴茎勃起的确切机理，至今尚未研究清楚，无论如何，清晨阴茎勃起是男子的一种正常的生理反应，是肯定无疑的，而且每天男子的个体差异所产生的变化也不尽一致，千万不能只凭这一点来判断男子性功能的好坏。诚然，医生在鉴别诊断性功能变化时，需要依此作为参考，那完全是限定病态情况时，而对于一个正常男子则不应盲目地从此来识别好坏。有些男子，一旦早晨勃起现象暂停或松弛时，他们就怀疑自己患了阳痿症，于是忧心忡忡，越是担心自己有阳痿，晨勃起现象就越少，甚至软弱无力。这是一种可怕的恶性循环，因为心理上的不安，会导致生理上的不健全;而生理方面的毛病又诱发心理上的进一步不安，如此往复，越来越坏。此时要赶快求医诊治。
不仅是清晨会勃起，如果仔细观察，睡眠时也常有勃起的情形。
在睡眠的过程中，会有间歇性的眼球快速运动期，而阴茎勃起也常发生在这时间。一般统计上，每天晚上会有三次到五次的勃起，每次勃起的时间，平均十五分钟，但也有长达一小时之久的。只要神经、血管及阴茎海锦体结构与功能正常，就会有这种现象，而这也是性功能的重要指标;在这段期间，阴茎的勃起比较不受心理因素的干扰，也较能实实在在表现出原本的功能，这种生理的现象，对性功能的研究及治疗，提供了极重要的指标。对於阳萎的患者而言，如果清晨起床时仍有勃起的现象，那麽此种阳萎可能是心理因素引起的，诊断及治疗的方向就随着调整，可以省略一些复杂的检查。
这种阴茎勃起的现象，在性医学上的研究，诊断及治疗极为重要，在早期为了作这方面的研究，患者要躺在观查睡眠用的实验室里，脑部、眼硷及阴茎接上测试线路，如果要记录阴茎勃起的硬度，则还要有观察员彻夜监看着，一发现勃起，立刻测量硬度，这种方法很不方便，误差也很大。
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